瓜拉牛拉被稱為是水鳥的天堂,這裏曾記錄過近200種的鳥類,常見的種類包括白鷺、翡翠鳥、 燕鷗、栗鳶及多種珩鷸類水鳥。每年九月起,當北半球開始進入冬季時,許多遷徙性水鳥即開始 飛往南方的熱帶國家過冬,有些甚至會飛到正當處於夏季的澳洲。由於瓜拉牛拉寬闊的紅樹林以 及周圍的泥灘可以提供候鳥充足的食物,因此是它們繼續飛往南方過冬途中的理想休息站或終點 站。這些候鳥在隔年的三月起,待北半球進入春天之後,將北返中國、蒙古及西伯力亞等國家繁殖。

除了遷徙性鳥類之外,瓜拉牛拉也是許多常年居住在這裏的鳥類的重要棲息地。其中以白環鸛和小禿鸛這兩種大型瀕臨絕種鳥類最受到環保人士的重視。為了保護這裏的鳥類,瓜拉牛拉以南的Kelumpang島的部分紅樹林及泥灘已被列為水鳥保護區(Kuala Gula Bird Santuary),由馬來半島野生動物保護及國家公園管理局(PERHILITAN)管轄。當局已於1994年在瓜拉牛拉設立一所水鳥解說中心,目的是保育瓜拉牛拉的鳥類以及向大眾推廣其相關知識。解說中心內不但有鳥類標本及海報展示,遊客還可以要求管理員展示及解說瓜拉牛拉水鳥的幻燈片和影片。除此之外,PERHILITAN的職員也常年在這裏進行水鳥的調查及研究工作。白鷺是瓜拉牛拉最常見的水鳥之一,常常成群在泥灘上覓食。